Μετά τη συγχώνευση με απορρόφηση από το σωματείο ΑΚΕΤΣ του ανδρικού και των υποδομών του ΕΟΣ το καλοκαίρι του 2012, εγκρίθηκε από το Ειρηνοδικείο Θεσσαλονίκης η τροποποίηση της ονομασίας του σωματείου σε Ένωση Καλαθοσφαίρισης Σταυρούπολη με το διακριτικό τίτλο Ε.Κ. Σταυρούπολη.
Το 2002 η ομάδα της ΑΚΕΤΣ δημιουργήθηκε από τη συγχώνευση των σωματείων Τυφώνας Θεσσαλονίκης και Α.Ο. Σταυρούπολης και πρόκειται για τη δεύτερη συγχώνευση μέσα σε μια δεκαετία.
